1.那么在發酵罐罐體是可以直接與物料接觸的場所，其中的表面光潔度的程度，以及內部構件的清潔度是被免染菌的主要因素。 
2.所以在每次發酵結束后，必須把頂蓋連同攪拌一起垂直向上拆卸下來，把所有電極取下來，放在安全的地方。用中性洗滌劑洗刷罐體及內部構件。（空氣分布器清洗見無菌空氣系統的維護）。 
3.在清洗的同時，應對罐及出口閥的一些O型密封圈進行檢查，如發現永久變形，老化，有劃傷等現象，需及時更換。 
4.在清洗完畢，重新安裝后，應對其外表面及罐架等用干凈抹布擦干凈，保證在待用的狀態。如果發酵罐將長期不使用時，則取下所有的電極，按要求規定存放，然后把罐內的存水及所有管路的存水放光，關閉閥門，用防塵布保護發酵罐。 
5.、攪拌系統的維護 攪拌系統包括攪拌軸、攪拌器、機械密封、軸承、聯軸器和電機等。由于是轉動部件，而且往往是變速轉動部件，周期也很長。 
6.所以在日常運轉中應經常注意軸的運轉情況，電機的發熱情況以及異常噪聲的發生，經常檢查有關的螺栓是否松動。每年要定期檢查機械密封的磨損情況。如有必要可更換動環，以保證機械密封的正常運轉，避免不必要的染菌可能。